Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CHD3Q12873 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CHD3Q12873 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CHD3Q12873 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CHD3Q12873 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CHD3Q12873 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CHD3Q12873 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CHD3Q12873 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CHD3Q12873 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CHD3Q12873 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CHD3Q12873 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHD3Q12873 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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