Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
STX4Q12846 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
STX4Q12846 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
STX4Q12846 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
STX4Q12846 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
STX4Q12846 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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STX4Q12846 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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STX4Q12846 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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STX4Q12846 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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STX4Q12846 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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STX4Q12846 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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