Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms