Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
POLEQ07864 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms