Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms