Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms