Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms