Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms