Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELAQ04206 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms