Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms