Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PGGT1BP53609 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PGGT1BP53609 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PGGT1BP53609 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PGGT1BP53609 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PGGT1BP53609 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PGGT1BP53609 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PGGT1BP53609 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PGGT1BP53609 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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