Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms