Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPC1P35052 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPC1P35052 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms