Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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OTX2P32243 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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OTX2P32243 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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OTX2P32243 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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OTX2P32243 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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OTX2P32243 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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OTX2P32243 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OTX2P32243 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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OTX2P32243 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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OTX2P32243 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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OTX2P32243 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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OTX2P32243 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OTX2P32243 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OTX2P32243 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OTX2P32243 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OTX2P32243 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OTX2P32243 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OTX2P32243 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OTX2P32243 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OTX2P32243 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OTX2P32243 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OTX2P32243 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OTX2P32243 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OTX2P32243 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OTX2P32243 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OTX2P32243 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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