Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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