Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms