Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms