Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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