Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms