Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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