Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms