Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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HOXA2O43364 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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HOXA2O43364 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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HOXA2O43364 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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HOXA2O43364 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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HOXA2O43364 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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HOXA2O43364 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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