Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBDO15205 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBDO15205 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBDO15205 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBDO15205 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBDO15205 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBDO15205 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBDO15205 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBDO15205 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBDO15205 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBDO15205 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBDO15205 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBDO15205 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBDO15205 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBDO15205 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
UBDO15205 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBDO15205 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms