Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms