Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms