Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms