Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms