Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms