Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms