Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN11AQ9UI33 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms