Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms