Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms