Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms