Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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