Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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