Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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