Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms