Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms