Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms