Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms