Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms