Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms