Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms