Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUB2Q96DC9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms