Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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