Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms