Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms