Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms