Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9P6

C9orf163, Uncharacterized protein C9orf163, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163Q8N9P6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf163Q8N9P6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf163Q8N9P6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms