Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms